【2026年】確定申告の修正のやり方｜期限内の出し直し・修正申告・更正の請求の違いと出し方｜やよい・freee・マネーフォワードを比較

確定申告を修正するやり方

ここでは、個人の所得税の確定申告を例にしています。説明は、国税庁のタックスアンサー「確定申告を間違えたとき」（令和8年4月1日現在法令等）、確定申告に関するよくある質問、「所得税及び復興特別所得税の更正の請求手続」、延滞税の計算方法のページなどをもとにしています（確認日：2026年10月30日）。

どこが誤りか、どの手続にあたるか、加算税がかかるかといった判断は、税金の個別の判断です。迷うときは、所轄の税務署や税理士に確認してください。

まず「いつ気づいたか」と「税額の向き」で分ける

最初に、自分がどのケースか確かめます。所得税の申告期限は、原則として翌年3月15日です（土日祝日なら翌日）。

期限内の出し直しは、一般に「訂正申告」と呼ばれることもあります。なお、最初の申告そのものが期限に間に合わなかった場合は、扱いが変わります。くわしくは「確定申告の期限を過ぎたらどうする？期限後申告のやり方」を参考にしてください。

期限内に気づいたとき：申告書を作り直して出し直す

国税庁のよくある質問では、申告期限内に誤りに気づいた場合は、正しい申告書をもう一度作って、期限までに提出するよう案内されています。

• 納める税金や戻る税金は、あとから出し直した申告書の金額になります。
• 最初の申告で還付金をすでに受け取っていて、出し直した申告書の還付金が少ない、または納税になる場合は、差額を納めます。
• 出し直した申告書の還付は、通常より時間がかかることがあります。

e-Taxで送った場合も同じです。e-Taxのよくある質問では、誤った箇所を直して申告書を作り直し、申告期限までにもう一度送信するよう案内されています。書面で出した場合は、作り直した申告書を期限までに税務署へ提出します。

会計ソフトで申告書を作った人は、ソフトの中で数字を直してから出し直すのが手早い方法です。今回比べる3つのソフトは、どれも期限内の出し直しの手順をヘルプなどで案内しています。

期限後に税額が少なかったとき：修正申告

期限を過ぎてから、税額が少なかった（または還付が多すぎた）と分かったときは、修正申告書を出します。国税庁は、税務署から更正を受けるまではいつでも出せるが、できるだけ早く出すよう案内しています。

修正申告のポイントは次のとおりです。

• 納期限：新たに納める税金の納期限は、修正申告書を出した日です。
• 延滞税：法定納期限の翌日から納める日までの日数に応じて、延滞税も納めます。
• 加算税：過少申告加算税がかかることがあります（割合は後で説明します）。
• 書き方：令和4年分以降は、申告書の第一表・第二表を使います。表題の空欄に「修正」と書き、変更した項目と理由を「特例適用条文等」の欄に書きます。

最初の申告が期限後申告だった場合は、過少申告加算税ではなく無申告加算税がかかることがあります。

期限後に税額が多かったとき：更正の請求

期限を過ぎてから、税額が多かった（または還付が少なかった）と分かったときは、更正の請求書を所轄の税務署長に出します。税務署が内容を調べて正しいと認めると、税額が減らされ、納めすぎた分が戻ります。

更正の請求ができる期間は、国税庁の手続のページで次のように案内されています。

注意したいのは次の2点です。

• 所得の金額などが変わっても、最終的な税額が変わらない場合は、更正の請求はできません。
• 請求の理由となる事実を証明する書類を添えます。たとえば、青色申告決算書（または収支内訳書）、帳簿の写し、領収書の写し、社会保険料控除証明書などです。

e-Taxと書面での出し方

修正申告書と更正の請求書は、国税庁の「確定申告書等作成コーナー」の中にある「更正の請求書・修正申告書作成コーナー」で作れます。提出先は、どちらも所轄の税務署です。

1. 作成コーナーを開く：作成コーナーのトップから、更正の請求書・修正申告書の作成に進みます。
2. 前の申告データを読み込む：最初に作成コーナーで作った申告書のデータ（.dataファイル）があれば、読み込んで、直す項目だけを入力できます。令和7年1月5日より前のバージョンで作ったデータの場合は、すべての項目を入力し直します。
3. 提出する：e-Taxで送信するか、印刷して郵送または税務署に持参します。

e-Taxで出す場合は、本人確認書類の提示や添付はいりません。書面でマイナンバーを書いて出す場合は、本人確認書類の提示か写しの添付が必要です。税務署の窓口は、原則として平日の9時から15時です。

加算税・延滞税のあらまし

修正申告をすると、加算税と延滞税がかかることがあります。国税庁のタックスアンサーに書かれている過少申告加算税の割合は、修正申告をしたタイミングで変わります。

「一定額」とは、当初の申告税額と50万円のいずれか多い金額です。このほか、帳簿の提示を拒んだ場合などは割合が上乗せされることがあり、場合によっては重加算税が課されることもあります。

延滞税は、納付が遅れた日数に応じてかかります。国税庁の案内では、令和8年の割合は、納期限の翌日から2か月を経過する日まで年2.8%、それ以後は年9.1%です。修正申告の場合の納期限は、修正申告書を出した日です。また、期限内に申告していて、1年以上たってから修正申告をした場合は、一定の期間が延滞税の計算から除かれる取り扱いもあります（重加算税が課された場合を除く）。正確な金額は、国税庁の延滞税の計算画面や税務署で確認してください。

間違いに気づいたら早めに動く

修正申告は、税務署から連絡が来る前に自分から出せば、過少申告加算税がかかりません。延滞税も日数で増えるので、気づいた時点で早めに動くのが大切です。更正の請求にも期間の決まりがあります。

• 申告期限の前か後か、税額が多かったか少なかったかを確かめた
• どの項目がいくら違ったのかを、帳簿や証明書で確かめた
• 期限内なら、正しい申告書を作り直して期限までに出し直した
• 期限後なら、作成コーナーで修正申告書か更正の請求書を作った
• e-Tax・郵送・持参のどれかで、所轄の税務署に出した
• 修正申告なら、出した日に追加の税金を納めた
• 加算税や延滞税の通知が届いたら、内容を確認して納めた

帳簿の数字も合わせて直す

申告書を直したら、もとになった帳簿の数字も合わせて直しておきます。帳簿と申告書の数字がずれたままだと、翌年の繰り越しや決算で、また数字が合わなくなります。会計ソフトを使っている場合は、直した取引の記録（仕訳）をソフトに入れておくと、翌年の申告がスムーズです。直し方が分からないときは、各ソフトのヘルプや税理士に確認してください。

比較表

会計ソフトは、期限内の出し直しには使えますが、期限後の修正申告書や更正の請求書の作成には、3つとも個人向けでは対応していないと案内しています。期限後は国税庁の作成コーナーを使い、ソフトは帳簿の修正と、正しい数字の確認に使う形になります。表は各社の公式サイト・ヘルプで確認できた内容だけを載せています。

料金は各公式サイトの税抜表記です（確認日：2026年10月30日）。やよいの青色申告 オンラインの初年度無料は、2027年3月15日までの申し込みが対象のキャンペーンで、条件があります。マネーフォワード クラウド確定申告は、2026年12月に料金体系の一部改定を予定していると案内しています。申し込む前に、各公式サイトで最新の内容を確認してください。