【2026年】年末調整のやり方|会社がやる手順とスケジュール、ソフト3選も比較

作成Tool & Scout 編集部
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調べ方各社の公式サイトと料金ページを確認し、同じ項目で比べました。

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タイプ別のおすすめ

  • 年税額の計算を任せたい人

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  • 年末調整を少額で済ませたい人

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    いちばん安いミニマムでも年末調整(管理者が入力)が使える

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  • 会計もまとめて使いたい人

    マネーフォワード クラウド給与

    スモールビジネスプランに給与と年末調整(各3名分)が入っている

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年末調整は、会社が従業員の代わりに1年分の所得税を計算し直して、払いすぎや不足を精算する手続きです。11月に準備を始め、12月の給与で精算し、翌年1月に書類を出して終わります。この記事では、初めて年末調整をする小さな会社や個人事業主に向けて、会社側の手順とスケジュール、令和8年分(2026年分)の変更点をまとめました。

年末調整の流れの図。1. 対象者を確認(11月上旬)、2. 申告書を配る・集める(11月〜12月上旬)、3. 中身をチェック、4. 年税額を計算、5. 過不足を12月の給与で精算、6. 税額を納める(原則翌年1月10日、納期の特例は1月20日)、7. 源泉徴収票・法定調書・給与支払報告書を翌年1月31日までに出す。令和8年分は基礎控除の引き上げ、扶養親族の所得要件が62万円以下へ、給与所得控除の最低額が74万円へ

年末調整とは

毎月の給与から引いている源泉所得税は、税額表にあてはめた「仮の額」です。生命保険料や家族の状況などは、毎月の計算には入っていません。そこで年の最後の給与のときに、1年分の給与と各種の控除をもとに正しい税額(年税額)を出し、それまでに引いた税額との差を精算します。これが年末調整です。

毎月の給与計算の流れは給与計算のやり方の記事にまとめています。この記事では、年末調整の部分にしぼって説明します。

令和8年分(2026年分)の主な変更点

国税庁の「令和8年分 年末調整のしかた」によると、今年は次の点が変わります(確認日:2026年10月20日)。

  • 基礎控除の引き上げ:合計所得金額に応じて段階的に引き上げられます。金額は所得によって違うので、国税庁の基礎控除額の表で確認してください。
  • 給与所得控除の最低保障額の引き上げ:給与の収入が190万円以下の場合、65万円から74万円になります。
  • 扶養親族などの所得要件の引き上げ:扶養親族や同一生計配偶者の所得要件が、合計所得金額58万円以下から62万円以下(給与だけなら収入136万円以下)になります。特定親族特別控除・配偶者特別控除・勤労学生の要件も変わります。
  • 生命保険料控除の特例:23歳未満の扶養親族がいる人は、新生命保険料の一般生命保険料控除の上限が4万円から6万円になります(令和8年分・令和9年分)。

令和8年11月までの毎月の源泉徴収は変わりません。改正後の基礎控除などは12月の年末調整で反映し、それまでの税額と精算します。今回の改正で新しく扶養親族の要件を満たす家族がいる従業員には、扶養控除等(異動)申告書を出し直してもらう必要があります。

年末調整のやり方(会社側の手順)

1. 対象になる人を確認する(11月上旬)

年末調整をするのは、会社に「扶養控除等(異動)申告書」を出している人のうち、次のような人です。

  • 1年を通じて勤めている人
  • 年の途中で入社して、年末まで勤めている人
  • 年の途中で退職した人のうち、一定の人(12月の給与を受けてから退職した人、その年の給与の合計が136万円以下のパートの人など)

反対に、次の人は年末調整をしません。本人が確定申告をすることになります。

  • その年の給与の収入が2,000万円を超える人
  • 2か所以上から給与を受けていて、他の会社に扶養控除等申告書を出している人(乙欄の人)
  • 年の途中で退職し、上の条件にあてはまらない人
  • 日雇いの人(丙欄の人)、非居住者

年の途中で入社した人は、前の勤め先の源泉徴収票が必要です。早めに出してもらいましょう。

2. 申告書を配って集める(11月〜12月上旬)

従業員に次の申告書を配り、記入して出してもらいます。用紙は国税庁のサイトからダウンロードできます。

  • 給与所得者の扶養控除等(異動)申告書:令和8年分は年初にもらっているはずです。家族の状況が変わった人には、内容を直してもらいます。あわせて、来年(令和9年分)の申告書も集めておくと、1月からの給与計算に使えます。
  • 基礎控除申告書 兼 配偶者控除等申告書 兼 特定親族特別控除申告書 兼 所得金額調整控除申告書:基礎控除・配偶者控除などを受けるための申告書です。1枚にまとまっています。
  • 給与所得者の保険料控除申告書:生命保険料、地震保険料、自分で払った国民年金保険料などを申告します。保険会社から届く控除証明書を添えてもらいます。
  • 住宅借入金等特別控除申告書:住宅ローン控除を受ける2年目以降の人だけです。税務署から本人に届く申告書と、金融機関の残高証明書を出してもらいます。

締め切りは、12月の給与計算に間に合う日に設定します。11月中に配り、12月の初めごろまでに回収する会社が多いです。

3. 申告書の中身をチェックする

集めた申告書を、控除証明書と照らし合わせて確認します。間違いが多いのは次の点です。

  • 扶養親族や配偶者の所得が、要件の範囲に入っているか(令和8年分は基準が変わっています)
  • 扶養親族の年齢区分(16歳未満、特定扶養親族、70歳以上など)
  • 保険料の金額が、控除証明書の金額と合っているか
  • 新しい生命保険料と古い生命保険料の区分

国税庁の「年末調整チェック表」を使うと、確認もれを減らせます。

4. 年税額を計算する

最後の給与の額が決まったら、1年分の給与(賞与を含む)と各種の控除をもとに、年税額を出します。大まかな流れは次のとおりです。

  1. 1年分の給与の総額から、給与所得控除後の金額を出す
  2. 所得金額調整控除があれば引く
  3. 社会保険料控除、生命保険料控除、扶養控除、基礎控除などを引いて、課税給与所得金額を出す(1,000円未満は切り捨て)
  4. 税率をかけて算出所得税額を出し、住宅ローン控除があれば引く
  5. 復興特別所得税を加えて、年調年税額を出す(100円未満は切り捨て)

手計算する場合は、国税庁が出している「年末調整計算シート」や源泉徴収簿を使います。ソフトを使う場合も、申告書の内容が正しく入っているかを必ず確認しましょう。

5. 過不足を精算する(12月の給与)

年調年税額と、1年間に源泉徴収した税額の合計を比べます。

  • 引きすぎていた場合(超過額):差額を従業員に返します。12月の給与に上乗せして返すのが一般的です。
  • 足りなかった場合(不足額):差額を12月の給与から追加で引きます。

返す分は、その月に納める源泉所得税から差し引いて調整します。年末調整のあとに、給与の追加払いや扶養親族の異動があった場合は、年末調整をやり直すことができます。

6. 源泉所得税を納める(翌年1月)

12月分の源泉所得税は、年末調整の精算をしたあとの額で、所得税徴収高計算書(納付書)をつけて納めます。

  • 原則:翌年1月10日まで。令和8年分の場合、令和9年1月12日(火)です。
  • 納期の特例を受けている場合:翌年1月20日まで(7〜12月分をまとめて納める)。

納める税額がゼロでも、納付書(所得税徴収高計算書)は作成して出します。

7. 源泉徴収票を渡し、調書と報告書を出す(翌年1月31日まで)

  • 源泉徴収票:従業員本人に渡します。
  • 法定調書合計表と源泉徴収票:税務署に出します。国税庁によると、令和8年分からは提出範囲が給与支払報告書と同じになり、年の途中で退職して給与が30万円以下の人を除いて原則として全員分が対象です。また、令和9年1月1日以後は、市区町村に給与支払報告書を出せば税務署にも源泉徴収票を出したものとみなされます(くわしくは源泉徴収票の書き方)。
  • 給与支払報告書:従業員の住所がある市区町村に出します。こちらは原則として全員分が必要で、翌年の住民税の計算に使われます。

提出の範囲は、国税庁の「給与所得の源泉徴収票等の法定調書の作成と提出の手引」で確認してください。

年末調整のスケジュール

時期作業
10月下旬〜11月上旬国税庁の資料で変更点を確認し、対象者と配る申告書を決める
11月申告書を配る。控除証明書をとっておくよう案内する
12月上旬申告書を回収し、中身をチェックする
12月の最後の給与年税額を計算し、過不足を精算する
翌年1月10日12月分の源泉所得税を納める(令和9年は1月12日)
翌年1月20日納期の特例を受けている場合の納期限
翌年1月31日源泉徴収票の交付、法定調書合計表・給与支払報告書の提出

日付は一般的な例です。期限が土日祝日にあたると、その翌日以降になります。国税庁の「年末調整がよくわかるページ」(令和9年1月下旬まで掲載予定)で最新の日程を確認してください。

比較表

従業員が数人でも、申告書の確認と年税額の計算は手間がかかります。年末調整の機能がある、小規模向けのクラウド給与計算ソフトを3つ比べます。

項目弥生給与 Nextfreee人事労務マネーフォワード クラウド給与
向いている人年税額の計算を任せたい年末調整を少額で済ませたい会計もまとめて使いたい
年末調整の計算が使えるプランベーシックライト以上全プランスモールビジネス以上(クラウド年末調整を含む)
そのプランの料金(税抜)ベーシックライト:年契約で月3,000円、月契約で月3,600円ミニマム:年払いで月2,000円、月払いで月2,600円(5名分。6名以降は1名400円)スモールビジネス:年払いで月4,480円、月払いで月5,980円
申告書のWeb回収エントリー以上(エントリーは年契約で月1,700円)スターター以上(ミニマムは管理者が入力)公式サイトで確認
法定調書の作成ベーシックライト以上公式サイトで確認公式サイトで確認
無料で試す20名未満の事業者は最大2か月無料無料のお試しあり(期間は公式サイトで確認)1か月の無料トライアル
公式サイト見る見る見る

料金は各公式サイトの表示です(確認日:2026年10月)。人数が各プランの基本人数を超えると、追加料金がかかります。マネーフォワード クラウドは2027年6月に料金体系の一部改定を予定していると公式サイトに書かれています。毎月の給与計算も含めた比べ方は給与計算ソフトの比較記事にまとめています。

弥生給与 Nextの特徴

弥生給与 Next(やよいきゅうよネクスト)は、弥生のクラウド給与計算ソフトです。従業員がWebで控除の申告書を入力するしくみはエントリー以上で使えます。年末調整の自動計算と法定調書の自動作成は、ベーシックライト以上のプランです。給与計算だけの「エントリーライト」は、2026年7月28日で新規の受付を終えています。

良い点

  • ベーシックライト以上なら、申告書の回収から年税額の計算、法定調書の作成までを1つのソフトで進められる
  • 給与計算と給与明細の作成は、人数に関係なく追加料金がかからない
  • 20名未満の事業者は、年末調整を含む機能を最大2か月無料で試せる

気になる点

  • いちばん安いエントリーでは、年末調整の計算ができない
  • Web年末調整などを使う人が基本人数を超えると、1名ごとに追加料金がかかる

弥生給与 Nextの公式サイトを見る

freee人事労務の特徴

freee人事労務は、給与計算と労務の手続きをまとめたクラウドサービスです。いちばん安いミニマムプランでも年末調整が使えます。ミニマムは管理者が申告書の内容を入力する方式で、従業員が自分でWeb入力する方式と電子申告はスタータープラン以上です。

良い点

  • ミニマムプランでも、毎月の給与計算と年末調整がそろっている
  • スタータープラン以上なら、従業員がWebで申告するので紙の回収と転記が減る
  • どのプランも初期費用はかからない

気になる点

  • 5名分が最低料金なので、従業員が1〜2名だと1人あたりは割高になる
  • 源泉徴収票や法定調書の作成範囲は、プランごとに公式サイトで確認が必要

freee人事労務の公式サイトを見る

マネーフォワード クラウド給与の特徴

マネーフォワード クラウド給与は、マネーフォワード クラウドのサービスの1つです。年末調整は「マネーフォワード クラウド年末調整」という別のサービスが担い、給与計算とつながっていて、結果を給与に反映できます。小規模向けのスモールビジネスプランには、給与と年末調整がそれぞれ3名分入っています(ビジネスプランは5名分)。

良い点

  • 1つのプランで、会計・給与・年末調整などをまとめて使える
  • 年税額の自動計算と、年末調整の電子申告に対応している
  • 1か月の無料トライアルがある

気になる点

  • 給与と年末調整だけを使う場合、月額は他の2つより高くなりやすい
  • 含まれる人数を超えると従量課金になり、2027年6月には料金体系の一部改定が予定されている

マネーフォワード クラウド給与の公式サイトを見る

年末調整ソフトの選び方

年税額の計算まで任せるか

申告書をWebで集めるだけなら、安いプランでも足りることがあります。年税額の計算と源泉徴収票の作成まで任せたいなら、その機能が入ったプランを選びます。弥生給与 Nextならベーシックライト以上が目安です。

従業員にWebで入力してもらうか

紙の申告書を集めて会社が入力するなら、freee人事労務のミニマムでも対応できます。人数が増えて転記が大変になってきたら、従業員がスマホやパソコンで入力する方式のプランを検討しましょう。

毎月の給与計算と同じソフトにする

年末調整では、1月からの給与と賞与のデータが必要です。毎月の給与計算と同じソフトを使えば、データを入れ直す手間がかかりません。年の途中で乗り換えるときは、それまでの支給データを移す必要があります。

11月より前に試しておく

3つとも無料で試せる期間があります。年末調整の時期に慌てないよう、10月ごろまでに申し込み、従業員の情報と今年の給与データを入れておくと安心です。

よくある質問

Q. 従業員が1人だけでも年末調整は必要ですか?

A. 扶養控除等申告書を出している従業員がいれば、人数にかかわらず原則として年末調整が必要です。自分のケースでの扱いは、税務署や税理士に確認してください。

Q. 従業員が申告書を出さなかったらどうなりますか?

A. 扶養控除等申告書を出していない人は、年末調整の対象になりません。保険料控除申告書などを出さなかった場合は、その控除を入れずに年末調整をします。控除を受けたい人は、本人が確定申告をすることになります。

Q. 年末調整のあとで間違いに気づいたら?

A. 源泉徴収票を渡す前(翌年1月31日まで)であれば、年末調整をやり直して精算できる場合があります。どう直すかは、税務署や税理士に相談してください。

Q. 社長(役員)の分も年末調整しますか?

A. 役員も給与(役員報酬)を受けていれば、一般の従業員と同じく年末調整の対象になります。ただし、給与の収入が2,000万円を超える場合は対象外です。

まとめ

年末調整は、対象者を確認する → 申告書を集める → 中身をチェックする → 年税額を計算する → 12月の給与で過不足を精算する → 1月に納める → 源泉徴収票などを出す、の順番で進めます。令和8年分は基礎控除や扶養親族の所得要件が変わるので、国税庁の「年末調整のしかた」と「年末調整がよくわかるページ」を確認し、判断に迷うところは税理士や税務署に相談してください。